Ευρύχωρες στοές και παρεκκλήσια συμπληρώνουν πολλές από τις μεγάλες εκκλησίες του Μυστρά, σε συνδυασμό με επιβλητικά πυργόσχημα κωδωνοστάσια. Οι στοές περιτρέχουν τους ναούς στη βόρεια και τη δυτική όψη τους. Τα παρεκκλήσια με ιδιαίτερα κομψές αναλογίες τοποθετούνται συνήθως στις τέσσερις γωνίες του ναού και στη νότια όψη του και εξυπηρετούν λατρευτικές ανάγκες των πιστών. Στην πλειονότητά τους έχουν ταφικό χαρακτήρα, όπως μαρτυρούν οι τάφοι που έχουν βρεθεί στο εσωτερικό τους, συνοδευόμενοι συχνά από τα ανάλογα πορτραίτα. Δεσπότες, μέλη των οικογενειών τους, πλούσιοι δωρητές, εκκλησιαστικοί και κρατικοί αξιωματούχοι φιλοξενούνταν σε αυτούς.

10. Στοές και παρεκκλήσια περιτρέχουν την Αγία Σοφία στη βόρεια, τη νότια και τη δυτική όψη της, ενώ ένα κομψό κωδωνοστάσιο υψώνεται στη βορειοδυτική γωνία του ναού.