Η προγραμματική σύμβαση μεταξύ ΥΠΠΟ-ΚΒ ΕΠΚΑ-Δήμου Κώ, σύμφωνα με το άρθρο 11 του Νόμου 1416/84, έχει σαν σκοπό τον καθαρισμό, τη διαμόρφωση, την αναδάσωση και συντήρηση των αρχαιολογικών χώρων και του περιβάλλοντα χώρου των μουσείων και μνημείων, αρμοδιότητας ΥΠΠΟ στα διοικητικά όρια του Δήμου Κώ.
Στην προγραμματική σύμβαση που έχει συναφθεί μεταξύ του ΥΠΠΟ, ΤΑΠ και του Δήμου Κώ από το 1986 έχουν περιληφθεί καθαρισμοί, περιφράξεις και διαμορφώσεις στους αρχαιολογικούς χώρους της πόλης Κώ, κατασκευή στεγάστρων, γεφυρών πρόσβασης, αντιστηρίξεις και κατασκευή έργων εξυπηρέτησης.
Συγκεκριμένα στο πρόγραμμα 2001-2002 εκπονήθηκε η μελέτη αποτύπωσης-αποκατάστασης του Επιγραφικού Μουσείου του Ασκληπιείου της Κώ και άρχισαν οι εργασίες αποκατάστασης του κτηρίου. Κατασκευάστηκε στέγαστρο στο δυτικό αρχαιολογικό χώρο και συγκεκριμένα στην οικία του Σιληνού για την προστασία των ψηφιδωτών δαπέδων.
Η αποκατάσταση της αναστηλωμένης Ρωμαϊκής οικίας, η μελέτη της οποίας εκπονήθηκε από το Γραφείο, εντάχθηκε στο Γ'ΚΠΣ.