Το 1995 στις εργασίες διάνοιξης της παραλιακής δημοτικής οδού στη δυτική επέκταση του πολεοδομικού σχεδίου της πόλης Θάσου στη Νήσο Θάσο είχαν εντοπιστεί τα θεμέλια μιας τρίκλιτης παλαιοχριστιανικής βασιλικής με ενδείξεις ότι στη νότια πλευρά της φέρει προσκτίσματα. Το 2001 με αφορμή την αίτηση ανέγερσης οικοδομής στο προς νότον οικόπεδο, ιδοκτησίας Ελ. Μερέση, το οποίο χωρίζεται από τη βασιλική με την εν λόγω οδό, αποκαλύφθηκε η ύπαρξη μιας δεύτερης βασιλικής. Μέχρι στιγμής αποκαλύφθηκαν δυο τρίκλιτες βασιλικές η μία δίπλα στην άλλη. Η βόρεια βασιλική καταλαμβάνει την αιγιαλίτιδα ζώνη και την δημοτική οδό. Είναι τρίκλιτη με νάρθηκα και ημικυκλική αψίδα. Χωρίζεται σε τρία κλίτη με κτιστούς στυλοβάτες πάνω στους οποίους εδράζονται αρχαία μαρμάρινα μέλη. Από το εσωτερικό της αποκαλύφθηκε ο κτιστός στυλοβάτης του φράγματος του πρεσβυτερίου και η βάση του άμβωνα. Στο μεσαίο κλίτος και κάτω από το δάπεδο διαμορφώνεται ταφική κρύπτη. Η νότια είναι και αυτή τρίκλιτη με νάρθηκα και ημικυκλική αψίδα. Στη νοτιοδυτική γωνία της προσκολλάται κογχωτό κτίσμα με ψηφιδωτό δάπεδο. Οι δύο βασιλικές επικοινωνούν μεταξύ τους με τρία προσκτίσματα τα δάπεδα των οποίων ακολουθούν τη διαφορά στάθμης μεταξύ των δαπέδων των δύο βασιλικών. Νότια της νότιας βασιλικής υπάρχει συγκρότημα δωματίων που περικλείουν τάφους. Σύμφωνα με τα έως τώρα δεδομένα η ύπαρξη των τάφων αποτέλεσε το έναυσμα για την δημιουργία του συγκροτήματος των βασιλικών που χρονολογούνται στον 5ο μ.Χ αι. η νότια και 6ο μ.Χ η βόρεια. Μετά την καταστροφή τους και στον χώρο του Ιερού Βήματος και των δύο βασιλικών ανιδρύθηκαν δύο μικρά ναϋδρια τα οποία συνέχισαν τη λατρεία στο χώρο έως και τα τέλη 12ου/αρχές 13ου αι. Η ανασκαφή συνεχίζεται.